中药材种子种苗是中医药产业的源头，其质量直接关系到药材的疗效与安全性。在基地建设过程中，除了标准与技术缺乏这一突出问题外，还面临多方面挑战。

种质资源保护与利用不足。许多野生中药材资源因过度采挖而濒危，人工繁育体系不完善，导致种质退化、品种混杂，影响药材的遗传纯度和药效稳定性。缺乏系统的种质资源库和基因库，难以实现优质种源的可持续供应。

市场监管与标准化体系薄弱。尽管部分药材有种子种苗标准，但执行力度不足，市场上伪劣种子流通现象普遍。基地建设缺乏统一的认证和追溯机制，农民或企业难以辨别种苗真伪，增加了生产风险。

第三，资金与基础设施投入不足。种子种苗基地建设需要长期投入，包括土地整理、灌溉设施、科研设备和人才引进等。许多地区财政支持有限，企业投资意愿低，导致基地规模小、技术落后，难以形成产业化优势。

第四，人才与技术推广滞后。专业人才匮乏，尤其是兼具农学和中药学知识的复合型人才稀缺。基层技术推广体系不健全，农民缺乏科学种植培训，导致种子处理、育苗管理等环节操作不规范，影响种苗成活率和药材质量。

第五，生态环境与气候变化影响。中药材生长对土壤、气候有特定要求，但工业污染、土地沙化等问题加剧，加上气候变化导致的极端天气频发，增加了种苗培育的不确定性，基地选址和适应性管理面临挑战。

产业链协同不足。种子种苗基地与种植、加工、销售环节脱节，信息共享机制缺失，导致供需失衡。例如，优质种苗可能因下游需求不明而滞销，而药农又难以获取可靠种源，形成恶性循环。

中药材种子种苗基地建设需从资源保护、标准完善、资金支持、人才培养、生态适应和产业链整合等多方面发力，才能夯实中医药发展基础，保障药材质量与供应安全。